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División Biología Molecular y Genética

DEPARTAMENTO DE BIOLOGÍA MOLECULAR

 

Perfiles:

 

Mecanismos de defensa de las plantas frente a patógenos microbianos.

Responsable: Dra. Inés Ponce de León.

Las plantas están expuestas constantemente al ataque por microorganismos patógenos, algunos de los cuales son capaces de causar enfermedad. El entendimiento de los mecanismos de defensa que participan en la respuesta de las plantas frente a la infección contribuirá a desarrollar nuevas estrategias de control de las enfermedades vegetales que involucren los mecanismos intrínsecos de defensa de las plantas, reduciendo el uso de pesticidas, insecticidas y otros productos químicos. Las respuestas de defensa a la infección por patógenos involucran la activación transcripcional de genes de defensa. Por ello, nuestro grupo de trabajo se ha centrado en identificar estos genes blanco, analizar su patrón de expresión en la respuesta de defensa vegetal, identificar las vías de transducción de señales involucradas en su inducción y determinar la función de las proteínas codificadas por estos genes en la resistencia vegetal. Como planta modelo utilizamos el musgo Physcomitrella patens el cual permite realizar estudios evolutivos de los mecanismos de defensa dada su posición filogenética entre las algas verdes y las angiospermas. Identificamos varios patógenos que infectan P. patens y demostramos que luego de la infección se activa una respuesta de defensa evidenciado por el fortalecimiento de la pared celular, la acumulación de especies reactivas del oxígeno y la inducción de genes relacionados con la defensa. Demostramos que P. patens no sintetiza ácido jasmónico y que el ácido salicílico, las auxinas y varias oxilipinas participan en la defensa frente a patógenos. Mediante la generación de mutantes knock out y sobreexpresantes hemos caracterizado la función de varias proteínas de defensa de P. patens. La expresión de alguna de estas proteínas en un sistema heterólogo como Arabidopsis thaliana aumenta la resistencia a patógenos demostrando la utilidad de P. patens como fuente de genes con posibles aplicaciones biotecnológicas.

 

Biología de la reproducción

Responsable: Dra. Adriana Geisinger.

La biología reproductiva es un tema en auge, en gran parte por sus potenciales aplicaciones tanto en reproducción humana como en producción animal. Algunas de las posibles aplicaciones son: el desarrollo de avances terapéuticos en relación a patologías del testículo que puedan provocar infertilidad y otras como cáncer de testículo (el tumor sólido más frecuente en hombres jóvenes en el mundo desarrollado), controles de calidad de semen, análisis de acción de agentes toxicológicos sobre la capacidad reproductiva, fertilización in vitro y clonación de individuos, generación de animales transgénicos (por ej. para xenotrasplantes), “pharming” animal, sexado de semen, investigaciones con células madre, etc.
Nuestro grupo se dedica al estudio de las bases moleculares de la espermatogénesis (proceso que lleva a la formación de los gametos masculinos) en mamíferos, empleando distintos roedores como modelo. Estamos centrados en la identificación y caracterización de genes expresados diferencialmente durante la espermatogénesis y en particular la profase meiótica (etapa inicial y determinante en el proceso de generación de gametos), y en la función de los productos de estos genes en relación con la espermatogénesis normal y con el desarrollo de patologías tales como infertilidad o cáncer testicular. Empleamos técnicas de RNAseq y generación de ratones knock-out mediante la técnica CRISPR/Cas9, entre otras.

 

Diagnóstico molecular, epidemiología y control de patógenos de cítricos.

Responsable: Ing. Agr. MSc Mercedes Peyrou.

La producción de alimentos para una demanda en permanente crecimiento es un desafío para nuestras sociedades. Uruguay -país productor de alimentos- ha puesto sus esfuerzos en lograr una mayor eficiencia en su agricultura para mejorar su competitividad en el mercado internacional. Las enfermedades de las plantas de interés económico son una de las principales causas de pérdidas tanto en los volúmenes de producción como en el valor que alcanza dicha producción en el mercado. Nuestro grupo, orientado hacia la fitopatología molecular, intenta contribuir al diagnóstico de patógenos vegetales (bacterias, hongos, virus y viroides), a la epidemiología de las enfermedades y a aspectos relacionados al control de dichas patologías en el campo. Dentro del cultivo de los cítricos –cuyo destino es la exportación de fruta fresca-, se ha dado prioridad a las enfermedades presentes nuestro país, sometidas a regulación por los países compradores. Es el caso de la cancrosis producida por la bacteria Xanthomonas citri susp. citri, a la mancha negra producida por el hongo Guignardia citricarpa, y a hongos relacionados a las pérdidas postcosecha como es el caso de los pertenecientes al género Penicillium y Geotrichum.

 

Profiles:

 

Plant defense mechanisms against microbial pathogens.

Principal Investigator: Dr. Inés Ponce de León.

Plants are constantly exposed to microbial pathogen attack, some of which can cause disease. The understanding of the mechanisms involved in plant responses against infection will contribute to the development of new strategies to control plant diseases. Strategies using intrinsic plant defense mechanisms will contribute to reduce the use of pesticides, insecticides and other chemicals. Activation of defense responses after pathogen assault involves the transcriptional induction of defense genes. Therefore, we focused our work on the identification of target genes, analysis of their expression patterns, identification of signal transduction pathways involved in their induction and analysis of the function played by the proteins encoded by these genes in plant resistance. As a model plant we use Physcomitrella patens since evolutionary studies of defense mechanisms can be performed due to its phylogenetic position between green algae and angiosperms. We have identified several pathogens capable of infecting P. patens and activate a defense response, evidenced by cell wall reinforcement, accumulation of reactive oxygen species and induction of defense related genes. We have demonstrated that P. patens do not synthesize jasmonic acid and that salicylic acid, auxins and several oxylipins participate in defense against pathogens. By generating knock out mutants and overexpressing plants we have characterized the function of several defense proteins in P. patens. The expression of some of these proteins in a heterologous system like Arabidopsis thaliana increases resistance against pathogens showing the usefulness of P. patens as a source of genes with potential biotechnological applications.

 

Biology of Reproduction

Principal Investigator: Dr. Adriana Geisinger.

Reproductive biology is a booming topic, partly due to its potential applications in human reproduction and in animal production. Some of the possible applications are: the development of therapeutic advances for testis pathologies that produce infertility, testicular cancer (by far the most frequent solid tumor in young men in the developed world) and other diseases, semen quality control tests, analyses of toxicological agents on reproductive abilities, in vitro fertilization and cloning, transgenic animals generation (e.g. for xenographts), animal pharming, semen sexing, ES cells research, etc.

Our group conducts its research on the study of the molecular bases of mammalian spermatogenesis (the process that produces male gametes), using different rodent species as experimental models. We are focused on the identification and characterization of differentially expressed genes along spermatogenesis and particularly in male meiotic prophase (initial and essential stage in the gamete-generation process), and on the role of their protein products in relation to normal spermatogenesis and disease. The methodologies we use are RNAseq and generation of knock-out mice by CRISPR/Cas9 methodology, among others.

 

Molecular diagnosis, epidemiology and control of citrus pathogens
Principal Investigator: Ing. Agr. MSc. Mercedes Peyrou.

The continuous increase of food demand is a permanent challenge for our societies. Uruguay, as a food producer country, has made efforts to improve the efficiency of its agriculture in order to achieve higher competitiveness in the international markets. Plant diseases in crops are the main cause of loses both in the production amounts and the value of this production. Our group, oriented to molecular phytopathology, contributes in the development of molecular methods for the diagnosis of plant pathogens (bacteria, fungi, virus and viroids), the epidemiology and the control of these diseases in the field. The Uruguayan citrus production is mainly exported and therefore there is high priority to control those diseases present in our country and subject to regulations from the purchasing countries. This is the case for canker disease produced by the bacteria Xanthomonas citri sbsp. citri, citrus black spot produced by the fungus Guignardia citricarpa and fungi from the genera Penicillium and Geotrichum responsible of postharvest loses.

 

 

Integrantes

Dra. Inés Ponce de León

Profesor Titular de Investigación.

iponce@iibce.edu.uy; iponcetadeo@gmail.com

Mag. Mercedes Peyrou

Profesor Adjunto de Investigación.

mpeyrou@iibce.edu.uy; mercepeyrou@gmail.com

Dra. Adriana Geisinger

Investigadora Honoraria Asociada al IIBCE. Prof. Adjunto Sección Bioquímica/Biología Molecular, Facultad de Ciencias.

ageisinger@iibce.edu.uy; adriana.geisinger@gmail.com

Dra. Rosana Rodríguez-Casuriaga

Investigadora Postdoctoral contrato IIBCE.

rrodriguez@iibce.edu.uy; r.rodriguezcasuriaga@gmail.com

Mag. Dra. Vet. Raquel del Campo

Contratada por proyecto.

rdelcampo@iibce.edu.uy; raqueldc60@gmail.com

Dra. Astrid Agorio.

Investigador Adjunto / Horas Docentes y de Investigación.

astridagorio@gmail.com

Mag. Adrián Capoano

Investigador Honorario. Estudiante de Doctorado Pedeciba-Biología.

acapoano@iibce.edu.uy; adrianca2@yahoo.com

Mag. Paola Russi

Investigador Asistente / Horas Docentes y de Investigación. Estudiante de Doctorado Pedeciba. Becario ANII.

prussi@iibce.edu.uy; polipa26@gmail.com

Mag. Eilyn Mena.

Contratada por Proyecto. Estudiante de Doctorado Pedeciba.Becario ANII.

eilyn.mena@gmail.com

Mag. María Fernanda Trovero.

Investigador Ayudante / Horas Docentes y de Investigación. Estudiante de Doctorado PEDECIBA. Becario ANII.

ftrovero@iibce.edu.uy

Mag. Leonardo Delgado.

Contratado por Proyecto. Estudiante de Doctorado Pedeciba. Becario ANII.

ledelcer@gmail.com

Mag. Guillermo Reboledo

Investigador Asistente / Horas Docentes y de Investigación. Becario ANII.

greboledo@iibce.edu.uy

Mag. Alfonso Alvarez

Investigador Honorario. Estudiante de Doctorado PEDECIBA. Asistente Laboratorio de Fisiología Vegetal, Centro de Investigaciones Nucleares, Facultad de Ciencias.

aalvarez@iibce.edu.uy

Lic. Fernanda Egui

Estudiante de grado, Licenciatura en Biología..

mfeugui@gmail.com

Lic. Lucía Vignale

Estudiante de Maestría Pedeciba Biología. Becario ANII.

luvignalee@gmail.com

Téc. Anat. Pat. Ricardo Larraya

Técnico preparador compartido medio tiempo con el Departamento de Genética

rlarraya@iibce.edu.uy ; rilale21@hotmail.com;

Bach. María Isabel Rodríguez

Contratada por proyecto

 

Otros Colaboradores

 

Dr. Marcos Montesano

Investigador Honorario Asociado al IIBCE. Prof. Adjunto Laboratorio de Fisiología Vegetal, Centro de Investigaciones Nucleares, Facultad de Ciencias.

montesano@cin.edu.uy

Ing. Agr. Héctor Mara

Contratado por proyecto.

hmara@iibce.edu.uy

 

Ex-integrantes

Dr. Rodolfo Wettstein

 

Dra. Carina Gaggero

.

Dra. Lucía D'Andrea.

 

 

Lic. Gianni Curti

 

 

Irene Da Cruz

 

 

Bach. Ana Godoy

.

 

Mag. Laura Camesasca

 

 

Ing. Agr. Luis Díaz Morales

 

 

Q.F. Marianne Barquet

.

 

Dra. Alexandra Castro

 

 

Quím. Manuel Minteguiaga

 

 

Dra. Laura Fariña

 

 

Lic. Lucina Machado

 

 

Lic. Andrés Goldman

 

 

Mag. Evangelina González-López

 

 

Mag. Sandra Jubany

 

 

Lic. Mariana Menoni

 

 

Lic. Juan Pablo Oliver

 

 

Bach. Fernando Navarrete

 

 

Bach. Pamela Mara

 

 

Lic. Mauricio Calviño

 

 

Lic. Lucila Pírez

 

 

Mag. Gabriela Cossio

 

 

actualizado el 14-08-2018.

Líneas de investigación:

 

Mecanismos de defensa de las plantas frente a patógenos microbianos
Responsable: Dra. Inés Ponce de León

El objetivo de esta línea de investigación es la identificación y análisis funcional de genes involucrados en la resistencia vegetal frente a microorganismos patógenos. Para ello se utilizan plantas de interés agronómico y plantas modelo. Dentro de los patosistemas en estudio se encuentran papa y Botrytis cinerea (B. cinerea) y soja yalgunos hongos importantes para este cultivo. Como planta modelo utilizamos el musgo Physcomitrella patens (P. patens), Arabidopsis thaliana y varios patógenos de amplio rango de hospedero incluyendo, Pectobacterium carotovoum subsp. carotovorum (P.c. carotovorum), B. cinerea, Colletotrichum gloeosporioides y Pythium.


Hemos sido pioneros en analizar la respuesta de defensa del musgo Physcomitrella patens (P. patens), el cual es resistente a diferentes tipos de estrés, estableciéndolo como planta modelo para el estudio de mecanismos de defensa vegetal y como posible fuente de genes y metabolitos a ser transferidos a cultivos (Ponce de León 2011; Ponce de León y Montesano 2013). Determinamos que P.c. carotovorum, Botrytis cinerea, Pythium y C. gloeosporioides son capaces de infectar y activar una respuesta de defensa en P. patens (Ponce de León et al., 2007, 2012; Oliver et al., 2009, Reboledo et al., 2015). En estas interacciones se inducen genes de defensa, se refuerza la pared celular, se acumulan especies reactivas del oxígeno y hormonas de defensa. Demostramos que el ácido jasmónico (JA) no se sintetiza en P. patens, mientras que el ácido salicílico aumenta luego de la infección con B. cinerea y activa una respuesta de defensa (Ponce de León et al., 2012, 2015). Este descubrimiento es realmente sorprendente ya que en plantas el JA es muy importante en la defensa contra patógenos necrótrofos e insectos. Demostramos que en respuesta a P.c. carotovorum P. patens activa las vías de producción de fenilpropanoides, auxinas y oxilipinas (Alvarez et al., 2016). Mediante la sobreexpresión de PR-10 de P. patens generamos plantas de este musgo y de Arabidopsis más resistentes a P. irregulare (Castro et al., 2016). Actualmente estamos sobreexpresando otros genes inducibles por estrés biótico en P. patens. Identificamos y caracterizamos el gen que codifica para una alfa-Dioxigenasa en P. patens (Hamberg et al., 2005, 2006) y demostramos mediante la sobreexpresión de la alfa-DOX que los productos de esta enzima regulan el desarrollo y aumentan la resistencia a patógenos (Machado et al., 2015; Ponce de León et al., 2015).

 

Biología Molecular de la Reproducción
Responsable: Dra. Adriana Geisinger

La biología reproductiva ha experimentado un importante auge en los últimos años, en gran parte por sus potenciales aplicaciones tanto en reproducción humana como en producción animal. Algunas de las posibles aplicaciones son: el desarrollo de avances terapéuticos en relación a patologías del testículo que puedan provocar infertilidad y otras como cáncer de testículo (el tumor sólido más frecuente en hombres jóvenes en el mundo desarrollado), controles de calidad de semen, análisis de acción de agentes toxicológicos sobre la capacidad reproductiva, fertilización in vitro y clonación de individuos, generación de animales transgénicos (por ej. para xenotrasplantes), “pharming” animal, sexado de semen, investigaciones con células madre, y otras. En este contexto, el continuo y marcado descenso en los índices de fertilidad masculina humana observado durante los últimos 50 años resulta altamente preocupante.
Nuestro grupo se dedica al estudio de la espermatogénesis masculina (proceso que lleva a la formación de los gametos masculinos) en mamíferos, empleando roedores como modelo. Concretamente, estamos centrados en la identificación y caracterización de genes expresados diferencialmente durante la profase meiótica (etapa inicial y determinante en el proceso de generación de gametos), y en la función de los productos de estos genes en relación con la espermatogénesis normal y con el desarrollo de patologías. Asimismo, hemos secuenciado el transcriptoma completo de las distintas etapas de la espermatogénesis, lo cual reviste un enorme interés tanto en el área básica como aplicada. Actualmente estamos analizando la participación de ARNs no codificantes en los procesos de reconocimiento de homologías y recombinación meióticas. Otra línea consiste en el estudio de la función de genes meióticos mediante la generación de ratones knock-out. Las metodologías empleadas incluyen secuenciación masiva de ARNs, técnicas de análisis de ácidos nucleicos y proteínas, microscopía confocal y citometría de flujo, CRISPR/Cas9, entre otras.

 

Fitopatología Molecular
Responsable: Ing. Agr. Mag. Mercedes Peyrou

La producción de alimentos para una demanda en permanente crecimiento es un desafío para nuestras sociedades. Uruguay -país productor de alimentos- ha puesto sus esfuerzos en lograr una mayor eficiencia en su agricultura para mejorar su competitividad en el mercado internacional. Las enfermedades de las plantas de interés económico son una de las principales causas de pérdidas tanto en los volúmenes de producción como en el valor que alcanza dicha producción en el mercado.

Nuestro grupo, orientado hacia la fitopatología molecular, intenta contribuir al diagnóstico de patógenos vegetales (bacterias, hongos, virus y viroides), a la epidemiología de las enfermedades y a aspectos relacionados al control de dichas patologías en el campo. Dentro del cultivo de los cítricos –cuyo destino es la exportación de fruta fresca-, se ha dado prioridad a las enfermedades presentes nuestro país, sometidas a regulación por los países compradores. Es el caso de la cancrosis producida por la bacteria Xanthomonas citri susp. citri, a la mancha negra producida por el hongo Phyllosticta citricarpa, y a hongos relacionados a las pérdidas postcosecha como es el caso de los pertenecientes al género Penicillium y Geotrichum.

 

Diagnóstico y detección

La identificación precisa y la sensibilidad de detección de dichos patógenos es indispensable para lograr un comercio seguro. En ese sentido se ha trabajo en el ajuste de las técnicas de detección adecuadas a cada patógeno, así como al momento y condiciones óptimas para su detección, y a la caracterización de sus aislamientos presentes en nuestro país.

 

Estudio de mecanismos de control de las enfermedades

El control eficiente de las enfermedades en el campo, es la forma de evitar la presencia de los distintos patógenos en el producto a comercializar. Para esto se han estudiado, a través de la detección y cuantificación de la expresión de genes relacionados a la defensa vegetal en el huésped y de genes relacionados a la patogenicidad en el patógeno, los mecanismos de acción de los plaguicidas a base de cobre en el control del cancro cítrico tendientes a optimizar su efecto.

 

Enfermedades causadas por hongos patógenos en poscosecha de frutas cítricas.

Las enfermedades causadas por hongos patógenos de poscosecha constituyen importantes factores de rechazo de la fruta producida en nuestro país, por los principales mercados a los que se destina (Unión Europea, MERCOSUR y potencialmente EEUU). Su control químico determina la acumulación de residuos de fungicidas, a niveles no aceptables en mercados extranjeros. Nuestro grupo de investigación viene desarrollando nuevas estrategias de control de podredumbres poscosecha, consistente en probar nuevos fungicidas más inocuos que los tradicionales, sales y desinfectantes de corta residualidad, baja toxicidad y capaces de reducir drásticamente esporas fúngicas. Esto le brindará al sector las condiciones necesarias para incrementar su competitividad, en la colocación de su producto en los mercados de destino actuales y potenciales.

 

actualizado el 8-02-2018.

Proyectos

 

Proyectos financiados por fondos concursables

 

“Fortalecimiento de las capacidades científicas y tecnológicas binacionales para el estudio molecular y celular de interacciones de la planta Physcomitrella patens con hongos”. Entidad financiadora: Agencia Mexicana de Cooperación Internacional para el Desarrollo (AMEXCID) y Agencia  Uruguaya  de  Cooperación  Internacional (AUCI). Fondo conjunto de cooperación México- Uruguay. Responsable Uruguay: Inés Ponce de León. Responsable México: Ramón Alberto Batista García. Participantes del IIBCE: Guillermo Reboledo y Astrid Agorio. 2018-2019.

 

“Estudio de la etiología y mecanismos de un tipo de infertilidad humana vinculada a mutaciones en genes para proteínas del complejo sinaptonémico”. Entidad financiadora: ANII, Proyecto Fondo Clemente Estable (FCE) Nivel II, 2017-2020. Responsable: R. Rodríguez Casuriaga. Participante: A. Geisinger.

 

"Red Nacional de Biotecnología Agrícola". Entidad Financiadora: ANII, Redes, ANII. RTS_1_2014_1. Integrantes del equipo investigador y Co-Responsables de la parte de estrés biótico: Inés Ponce de León y Marcos Montesano. 2016-2019.

 

"Rol de los ARNs no codificantes largos en la espermatogénesis". Entidad financiadora: ANII, FCE 2014_104251. Investigadora Responsable: A. Geisinger. 2016-2018.

 

"Evaluación de un receptor de la membrana plasmática de las células de Solanum tuberosum como inductor de mecanismos de defensa a tizón temprano y tardío de la papa". Entidad Financiadora: ANII, FMV_1_2014_1_104607. Investigador responsable: Marcos Montesano. Integrante del equipo: Inés Ponce de León. 2015-2017.

 

"Ajuste del modelo Alter- Rater para el control de mancha marrón de Alternaria en mandarina Nova en Uruguay". Entidad Financiadora: ANII-FSA. Investigadora responsable: Mercedes Peyrou, Participantes: Paola Russi. 2014-2017.

 

"Activación de mecanismos de defensa mediados por oxilipinas y el ácido salicílico en la planta Physcomitrella patens en respuesta a microorganismos patógenos".Entidad Financiadora: ANII FCE2011_6095. Investigadora Responsable: Inés Ponce de León. 2013-2014.

 

"Genómica de la reproducción: Estudio del transcriptoma durante el desarrollo de la línea germinal masculina mediante citometróa de flujo, secuenciación masiva y bioinformática". Entidad financiadora: ANII, FCE 20141_6742. Investigadora Responsable: A. Geisinger. 2013-2015.

 

"Ingeniería metabólica para la producción de biocombustibles isoprenoides". Entidad Financiadora: Fondo Sectorial de Energía, ANII. Proyecto FSE_1_2011_1_6068. Responsable: Carina Gaggero. Integrantes del equipo: Laura Fariña, Laura Camesasca, Manuel Minteguiaga. 2012-2014.

 

"Biodiversidad microbiana de la uva y su aplicación en la Biotecnología de Alimentos". Investigadores Responsables: Francisco Carrau. Integrado por grupos de Dres. Carrau y Dellacassa de Facultad de Quómica, Disegna de INIA y C. Gaggero de IIBCE. Entidad Financiadora: Programa ó+D Grupos CSIC, Area Tecnologica. 2011-2014.

 

Proyectos financiados por fondos no concursables:

 

"Implementación y desarrollo de la metodología de producción de papa semilla de calidad genética y sanitaria". Investigadora responsable: Mercedes Peyrou. 2015-2017.

 

actualizado el 15-02-2018.

Publicaciones 2014 - 2018

 

Perroud PF, Haas FB, Hiss M, Ullrich KK, Alboresi A, Amirebrahimi M, Barry K, Bassi R, Bonhomme S, Chen H, Coates J, Fujita T, Guyon-Debast A, Lang D, Lin J, Lipzen A, Nogué F, Oliver MJ, Ponce de León I, Quatrano RS, Rameau C, Reiss B, Reski R, Ricca M, Saidi Y, Sun N, Szövényi P, Sreedasyam A, Grimwood J, Stacey G, Schmutz J, Rensing SA. 2018. The Physcomitrella patens gene atlas project: large scale RNA-seq based expression data. Plant J. 95:168-182.

 

Geisinger A, Rodríguez-Casuriaga R. 2017. Flow cytometry for the isolation and characterization of rodent meiocytes. Methods Molec. Biol. 1471:217-230.

 

Ponce De León I, Montesano M. 2017. Adaptation mechanisms in the evolution of moss defenses to microbes. Front. Plant Sci. 8:366. doi: 10.3389/fpls.2017.00366.

 

Alvarez A, Montesano M, Schmelz E, Ponce De León I. 2016. Activation of shikimate, phenylpropanoid, oxylipins and auxin pathways in Pectobacterium carotovorum elicitors-treated moss. Front. Plant Sci. 7:328. doi: 10.3389/fpls.2016.00328.

 

Bressendorff S, Azevedo R, Kenchappa CS, Ponce de León I, Rasmussen MW, Erbs G, Newman M-A, Petersen M, Mundy J. 2016. An innate immunity pathway in the moss Physcomitrella patens. Plant Cell. 28:1328-1342.

 

Castro A, Vidal S, Ponce de León I. 2016. Moss Pathogenesis-Related-10 Protein Enhances Resistance to Pythium irregulare in Physcomitrella patens and Arabidopsis thaliana. Front. Plant Sci. 7:580. doi: 10.3389/fpls.2016.00580.

 

Da Cruz I, Rodríguez-Casuriaga R, Santiñaque FF, Farías J, Curti G, Capoano CA, Folle GA. Benavente R, Sotelo-Silveira JR, Geisinger A. 2016. Transcriptome analysis of highly purified mouse spermatogenic cell populations: gene expression signatures switch from meiotic-to-postmeiotic-related processes at pachytene stage. BMC Genomics 17:294. DOI 10.1186/s12864-016-2618-1.

 

Geisinger A, Benavente R. 2016. Mutations in Genes Coding for Synaptonemal Complex Proteins and Their Impact on Human Fertility. Cytogenet Genome Res.150:77-85.

 

Bao LV, Scatoni IB, Gaggero C, Gutiérrez L, Monza J, Walker MA. 2015. Genetic diversity of grape phylloxera leaf-galling populations on Vitis species in Uruguay. Am. J. Enol. Vitic. 66:46-53.

 

Carrau F, Gaggero C, Aguilar PS. 2015. Yeast diversity and native vigor for flavor phenotypes. Trends in Biotechnology 33:148-154. Portada de la revista.

 

Díaz LE, del Campo R, Mara H. 2015. In Vitro Effectiveness of Disinfectants on Geotrichum citri-aurantii Spore Viability. Acta Hort. 1065:1571-1575.

 

Goldman A, Rodríguez Casuriaga R, González-López E, Capoano CA, Santiñaque F, Geisinger A. 2015. MTCH2 is differentially expressed in rat testis and mainly related to apoptosis of spermatocytes. Cell Tissue Res. 361: 869-883.

 

Machado L, Castro A, Hamberg M, Bannenberg G, Gaggero C, Castresana C, Ponce de León I. 2015. The Physcomitrella patens unique alpha-dioxygenase participates in both developmental processes and defense responses. BMC Plant Biology. 15:45.

 

Nuñez F, del Campo R, Pascale D, Díaz LE, Solari J, Larrechart L, Mara H. 2015. Effect of Storage Temperature on Rind Pitting and Fruit Rot in Satsuma ‘Okitsu’. Acta Hort. 1065: 1541-1548.

 

Ponce de León I, Hamberg M and Castresana C. 2015. Oxylipins in moss development and defense. Front. Plant Sci. 6:483.

 

Reboledo G, del Campo R, Alvarez A, Montesano M, Mara H, Ponce de León I. 2015. Physcomitrella patens activates defense responses against the pathogen Colletotrichum gloeosporioides. Int. J. Mol. Sci. 16: 22280-22298.

 

Rodríguez-Casuriaga R, Santiñaque FF, Folle GA, Souza D, López-Carro B, Geisinger A. 2014. Rapid preparation of rodent testicular cell suspensions and spermatogenic stages purification by flow cytometry using a novel blue-laser-excitable vital dye. MethodsX. 1: 239-243.

 

Giorello FM, Berná L, Greif G, Camesasca L, Salzman V, Medina K, Robello C, Gaggero C, Aguilar PS, Carrau F. 2014. Genome Sequence of the Native Apiculate Wine Yeast Hanseniaspora vineae T02/19AF. Genome Announc. 2(3). pii: e00530-14. doi: 10.1128/genomeA.00530-14.

 

Geisinger A, Rodríguez-Casuriaga R, Santiñaque FF, Folle GA. 2014. Revisiting testicular cell suspensions and meiocytes sorting. Cytometry A. 85: 989-990.

 

Goldman A, Capoano CA, González-López E, Geisinger A. 2014. Identifier (ID) elements are not preferentially located to brain-specific genes: high ID element representation in other tissue-specific- and housekeeping genes of the rat Gene 533: 72-77.

actualizado el 17-07-2018.

Orientación de estudiantes:

 

Pasantías de Grado:

 

Fernanda Eugui. (en curso). Tesina de grado, Licenciatura en Biología. “Evaluación de la activación de respuestas de defensa en la interacción Arabidopsis thaliana-Diaporthe phaseolorum var. caulivora”. Orientadora: Inés Ponce de León y Co-orientadora: Eilyn Mena.

 

Lucía Vignale. 2017. Tesina de grado, Licenciatura en Bioquímica. “Estudio de la función de un gen novedoso del musgo Physcomitrella patens en la respuesta de defensa vegetal de la planta Arabidopsis thaliana”. Orientadora: Inés Ponce de León y Co-orientador: Guillermo Reboledo.

 

Isabel Rodríguez Assandri. 2015. "Caracterización de aislamientos del hongo Alternaria alternata, causante de la mancha marrón de los cítricos en Uruguay".  Licenciatura en Biología, Facultad de Ciencias, UdelaR. Orientadora: Mercedes Peyrou.

 

Tesis de Maestría:

 

Elisa Souza. (en curso). "Evaluación de la utilidad de nuevos fluorocromos vitales para la clasificación en flujo de diversos estadios espermatogénicos en el ratón". Orientadora: Rosana Rodríguez-Casuriaga. Coorientadora: Adriana Geisinger.

 

Gianni Curti. (en curso). "Análisis del transcriptoma de la profase meiótica masculina temprana en el ratón". Maestría en Biología Celular y Molecular PEDECIBA, UdelaR. Orientador: Gustavo Folle. Coorientadora: Adriana Geisinger.

 

Laura Camesasca. 2015. "Ingeniería metabólica de Saccharomyces cerevisiae para la producción de biocombustibles". Maestría en Biotecnología, Facultad de Ciencias, UdelaR, Uruguay. Orientadora: Carina Gaggero.

 

Guillermo Esteban Reboledo. 2015. “Evaluación de la resistencia a patógenos en P. patens y A. thaliana mediante la sobreexpresión de un factor de transcripción con dominio AP2”. Maestría en Biología PEDECIBA, subárea Biología Molecular y Celular. Orientadora: Inés Ponce de León.

 

Paola Russi. 2014. "Análisis de la expresión diferencial de genes de Xanthomonas axonopodis pv. citri, relacionados a la patogenicidad, inducidos por cobre". Maestría en Biotecnología, UdelaR. Orientadora: Inés Ponce de León. Co-orientadora: Mercedes Peyrou.

 

Tesis de Doctorado:

 

Guillermo Reboledo. (en curso). “Caracterización funcional de un posible factor de transcripción con dominio AP2/ERF responsable de incrementar la resistencia de Physcomitrella patens a importantes patógenos de cultivo”. Doctorado en Ciencias Biológicas, opción Biología Celular y Molecular PEDECIBA. Orientadora: Inés Ponce de León.

 

Alfonso Alvarez. (en curso). “Caracterización molecular de mecanismos de defensa vegetal desarrollados frente a microorganismos patógenos”. Doctorado en Ciencias Biológicas, opción Biología Celular y Molecular PEDECIBA. Orientador: Marcos Montesano, Co-Orientadora: Inés Ponce de León.

 

María Fernanda Trovero. (en curso). "Rol de los ARNs no codificantes largos en la espermatogénesis". Doctorado en Ciencias Biológicas, opción Biología Celular y Molecular PEDECIBA, UdelaR. Orientadora: Adriana Geisinger. Co-orientadores: José Sotelo Silveira y Rosana Rodríguez.

 

Eilyn Mena. (en curso). “Cancro del tallo de la soja: Caracterización molecular del patosistema Glycine max-Diaporthe phaseolorum”. Doctorado en Ciencias Biológicas, opción Biología Celular y Molecular PEDECIBA. Orientadora: Inés Ponce de León, Co-Orientador: Marcos Montesano.

 

Paola Russi. (en curso). “Evolución de las vías de producción y percepción de oxilipinas en plantas y su rol en la respuesta de defensa frente a patógenos”. Doctorado en Ciencias Biológicas, opción Biología Celular y Molecular PEDECIBA. Orientadora: Inés Ponce de León.

 

Leonardo Delgado. (en curso). “Análisis de receptores tipo quinasa de membrana plasmática en soja y su posible participación en la defensa frente a hongos”. Doctorado en Ciencias Biológicas, opción Biología Celular y Molecular PEDECIBA. Orientadora: Marcos Montesano, Co-Orientadora: Inés Ponce de León.

 

Carlos Adrián Capoano. (en curso). "Estudio funcional del gen Spats1 y su rol en la espermatogénesis". Doctorado PEDECIBA. Orientadores: Adriana Geisinger y Dr. Ricardo Benavente (Univ. de Würzburg, Alemania). Co-orientadora: Rosana Rodríguez.

 

Cecilia Da Silva. 2016. "Secuenciación masiva del genoma/transcriptoma de Vitis vinifera cv. Tannat: aromas y polifenoles durante el desarrollo del grano de uva". Doctorado en Ciencias Biológicas, opción Biología Celular y Molecular PEDECIBA, UdelaR. Orientador: Francisco Carrau. Co-orientadores: Carina Gaggero y Massimo Delledonne.

 

Alexandra Castro. 2014. "Physcomitrella patens: un nuevo modelo vegetal para el estudio de interacciones planta patógeno". Doctorado en Ciencias Biológicas, opción Biología Celular y Molecular PEDECIBA, UdelaR. Orientadora: Inés Ponce de León Co-orientadoras: Carmen Castresana y Sabina Vidal.

 

actualizado el 8-02-2018.

Docencia:

 

Docencia de posgrado (2011 - 2016)

 

2013, 2014 – curso de posgrado PEDECIBA “Regulación de la Expresión Génica en los Eucariotas”. Facultad de Ciencias, UDELAR, Montevideo, Uruguay. Participación docente: Adriana Geisinger.

 

2013– Curso internacional de posgrado ANII/PEDECIBA “Cromosomas, Estructura, Función y Evolución”. IIBCE, Montevideo, Uruguay. Participación docente: Adriana Geisinger y Rosana Rodríguez-Casuriaga.

 

2012– Curso de posgrado PEDECIBA: “Temas en Biología de la Reproducción – Aplicaciones en Biología Reproductiva”. Facultad de Medicina UDELAR, Montevideo, Uruguay. Coordinadora: Adriana Geisinger. Participación docente: Adriana Geisinger y Rosana Rodríguez-Casuriaga.

 

2012 – Curso de posgrado PEDECIBA/ANII “Arquitectura y dinámica del núcleo celular”. Participación docente: Adriana Geisinger y Rosana Rodríguez-Casuriaga.

 

2012 Curso internacional de posgrado “Phisiology of the gametes, pathology and reproduction in humans and animals”. Facultad de Medicina UDELAR, Montevideo, Uruguay. Participación docente: Adriana Geisinger

 

2011 – Curso internacional de posgrado Fundación Alexander von Humboldt/IIBCE/ANII/PEDECIBA “Nuclear Architecture, Chromosome Territories, Chromatin Dynamics and Genetic Damage”. Participación docente: Adriana Geisinger y Rosana Rodríguez-Casuriaga.

 

Dictado de clases dentro de cursos de posgrado

 

2016 Curso de Posgrado “Enología y Biotecnología de las fermentaciones”, Facultad de Química, Montevideo, Uruguay. Participación docente: Cecilia Da Silva.


2015-2013 Curso teórico-práctico de posgrado PEDECIBA Interacción planta-microorganismo patógeno: mecanismos de virulencia y activación de la defensa vegetal, IIBCE y Facultad de Ciencias, Montevideo, Uruguay. Docentes responsables: Inés Ponce de León y Marcos Montesano.


2015-2014 Curso de postgrado PEDECIBA, Fisiología Vegetal, Facultad de Ciencias, Montevideo, Uruguay. Coordinador: Marcos Montesano. Participación Docente: Alfonso Álvarez e Inés Ponce de León.


2012-2014 Curso Gestión de Colecciones y Conservación de microorganismo. Facultad de Ingeniería, Responsables: Lyliam Loperena y Mercedes Peyrou.


2014 Curso de postgrado de la Maestría en Ciencias Agrarias, Mejoramiento vegetal por resistencia a enfermedades y plagas, Facultad de Agronomía, Montevideo, Uruguay. Participación docente: Inés Ponce de León.


2014 Curso de postgrado PEDECIBA y Maestría en Biotecnología “Genética Molecular y Biotecnología Vegetal”, Facultad de Ciencias, Montevideo, Uruguay. Participación docente: Inés Ponce de León.

 

2012 Curso de posgrado “Arquitectura y Dinámica del Núcleo Celular”, IIBCE, Montevideo, Uruguay. 5-14 de marzo. Participación docente: R. Rodríguez-Casuriaga y A. Geisinger.

 

2011 Curso de Posgrado Regional “Herramientas moleculares para la identificación y caracterización de hongos filamentosos y levaduras”, Facultad de Quimica, Montevideo, Uruguay. 16 al 21 de mayo. Participación docente de C. Gaggero.

 

2011 Curso internacional de posgrado (Fundación Alexander von Humboldt/IIBCE/ANII/PEDECIBA): “Nuclear Architecture, Chromosome Territories, Chromatin Dynamics and Genetic Damage”. Coordinadores: Dres. Gustavo Folle y Ricardo Benavente. Participación docente de A. Geisinger y R. Rodríguez-Casuriaga.

 

2011 Segunda Escuela de Microbiología, PEDECIBA. Participación docente de I. Ponce de León.

Curso de posgrado de la Maestría en Biotecnología y PEDECIBA, Genética Molecular y Biotecnología Vegetal, Facultad de Ciencias, Montevideo, Uruguay. Participación docente de I. Ponce de León y C. Gaggero 2011, 2009, 2008, 2007. Dictado de teóricos y participación en algunos talleres. Práctico de plantas con promotores de alpha-DOX fusionado a GUS, 6 h de práctico por aío, 2011, 2009, 2008, 2007 A. Castro.

 

Curso de Posgrado “Enología y Biotecnología de las fermentaciones”, Facultad de Química, Montevideo, Uruguay. Participación docente de C. Gaggero en los cursos de los años 2007 al 2015 inclusive.

 

actualizado el 20-06-2016.

Otros:

 

2016. Curso de Posgrado "Enología y Biotecnología de las fermentaciones", Facultad de Química, Montevideo, Uruguay. Participación docente: Cecilia Da Silva.


2015-2013. Curso teórico-práctico de posgrado PEDECIBA Interacción planta-microorganismo patógeno: mecanismos de virulencia y activación de la defensa vegetal, IIBCE y Facultad de Ciencias, Montevideo, Uruguay. Docentes responsables: Inés Ponce de León y Marcos Montesano.


2015-2014. Curso de postgrado PEDECIBA, Fisiología Vegetal, Facultad de Ciencias, Montevideo, Uruguay. Coordinador: Marcos Montesano. Participación Docente: Alfonso Álvarez e Inés Ponce de León.


2012-2014. Curso Gestión de Colecciones y Conservación de microorganismo. Facultad de Ingeniería, Responsables: Lyliam Loperena y Mercedes Peyrou.


2014. Curso de postgrado de la Maestría en Ciencias Agrarias, Mejoramiento vegetal por resistencia a enfermedades y plagas, Facultad de Agronomía, Montevideo, Uruguay. Participación docente: Inés Ponce de León.


2014. Curso de postgrado PEDECIBA y Maestría en Biotecnología “Genética Molecular y Biotecnología Vegetal”, Facultad de Ciencias, Montevideo, Uruguay. Participación docente: Inés Ponce de León.

 

Colaboraciones en el IIBCE

Dr. Gustavo Folle. Servicio de citometría y clasificación celular.

 

En el país

Dra. Martina Crispo. Unidad de Animales Transgénicos y de Experimentación, Institut Pasteur de Montevideo.

Dra. Sabina Vidal. Laboratorio de Biología Molecular Vegetal. Facultad de Ciencias, UdelaR.

Dr. Marcos Montesano, Laboratorio de Fisiología Vegetal, Facultad de Ciencias, UdelaR.

Dr. Francisco Carrau, Seccion Enologia, Facultad de Quimica

Dra. Ivanna Tomasco, Seccion Evolucion, Facultad de Ciencias

Dr. Hugo Naya. Bioinformática, Institut Pasteur de Montevideo

Dr. Pablo Aguilar. Institut Pasteur de Montevideo

Dr. Pablo Aguilar, Biología Celular de Membranas, Institut Pasteur de Montevideo

Ing.Agr. MSc. Elena Pérez, INIA Salto Grande

 

En el exterior

Dr. Ricardo Benavente. Departamento de Biología Celular y del Desarrollo, Biocentro, Universidad de Würzburg, Alemania.

Dra. Carmen Castresana. Jefa del Departamento Genética Molecular de Plantas, Centro Nacional de Biotecnología, CSIC, Madrid España.

Dr. Mats Hamberg. Jefe del "Division of Physiological Chemistry II", Department of Medical Biochemistry and Biophysics, Karolinska Institutet, Estocolmo, Suecia.

Dr. Eric Schmelz, U.S. Department of Agriculture-Agricultural Research Service, Center for Medical, Agricultural, and Veterinary Entomology, Gainesville, Florida, USA.

Dra. Mariana Combina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria (INTA), Mendoza, Argentina.

Dr. Massimo Delledonne de la Universidad de Verona, Italia.

Dr. Alexandre de Moraes. Centro de Citricultura "Sylvio Moreira", Araraquara, San Pablo, Brasil.

 

actualizado el 11-04-2016.

Galería de Fotos

 

actualizado el 27-07-2012

Contacto:

Inés Ponce de León

Mail: iponce@iibce.edu.uy ; iponcetadeo@gmail@gmail.com>

Teléfono: (598) 24871616 int. 130

actualizado el 08-02-2018.