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División Ciencias Microbiológicas

DEPARTAMENTO DE GENÓMICA

 

Perfil

 

En contrucción

 

 

Profile

 

 

Integrantes

Dr. José Roberto Sotelo Silveira

Profesor Titular de Investigación.

jsotelosilveira@iibce.edu.uy ; sotelojos@gmail.com

Lic. Joaquina Farías

Investigadora Honoraria. Estudiante de Maestría PEDECIBA- Biología.

jfarias@iibce.edu.uy ; joaquinafarias@gmail.com

Lic. Valeria Romero

Investigadora Honoraria. Estudiante de Maestría PEDECIBA- Biología.

vromero@iibce.edu.uy ; vromero@fcien.edu.uy

Lic. Guillermo Eastman

Investigador Asistente / Horas Docentes y de Investigación. Estudiante de Maestría PEDECIBA-Biología.

geastman@iibce.edu.uy ; guillepapal@gmail.com

Bach. Andrés Di Paolo

Investigador Honorario. Estudiante de Lic. Biología.

adipaolo@iibce.edu.uy ; apdipaolo@gmail.com

Lic. Pablo Peraza

Investigador Honorario. Estudiante de Maestría PEDECIBA-Biología.

pperaza@lb.inia.org.uy

Dra. en Medicina Laura Vera

Investigadora Honoraria. Estudiante de Maestría en Bioinformática PEDECIBA.

Bach. Mathías Martínez

Investigadora Honoraria. Estudiante de Grado.

actualizado el 4-6-2014.

Líneas de investigación:

 

 

En contrucción

 

actualizado el 4-6-2014.

Proyectos

 

En contrucción

 

actualizado el 4-06-2014.

Publicaciones 2014 - 2018

 

Smircich P, Eastman G, Bispo S, Duhagon MA, Guerra-Slompo EP, Garat B, Goldenberg S, Munroe DJ, Dallagiovanna B, Holetz F, Sotelo-Silveira JR. 2015. Ribosome profiling reveals translation control as a key mechanism generating differential gene expression in Trypanosoma cruzi. BMC Genomics 16:443.

Pizzo L, Iriarte A, Alvarez-Valin F, Marín M. 2015. Conservation of CFTR codon frequency through Primates suggests synonymous mutations could have a functional effect. Mutation Research - Fundamental and Molecular Mechanisms of Mutagenesis, 775:19-25.

Rodríguez MC, Loaces I, Amarelle V, Senatore D, Iriarte A, Fabiano E, Noya F. 2015. Est10: a novel alkaline esterase isolated from bovine rumen belonging to the new family XV of lipolytic enzymes. PLoS ONE, 1-16.

Martínez-Rosales C, Marizcurrena JJ, Iriarte A, Fullana N, Romero H, Castro-Sowinski S. 2015. Characterizing proteases in an Antarctic Janthinobacterium sp. isolate. Evidence of a protease horizontal gene transfer event. Advances in Polar Science, 26: 88-95.

Traglia G, Dixon C, Chiem K, Almuzara M, Barberis C, Montaña S, Merino C, Mussi M, Tolmasky M, Iriarte A, Vay C, Ramirez MS. 2015. Draft Genome Sequence of Empedobacter falsenii comb. nov. (ex-Wautersiella falsenii) Wf282, a strain isolated from a cervical neck abscess. Genome Announcements. 3:2.

Traglia G, Almuzara M, Barberis C, Montaña S, Schramm STJ, Enriquez B, Mussi M, Vay C, Iriarte A, Ramirez MS. 2015. Draft genome sequence of taxonomically unique Acinetobacter clinical strain with proteolytic and hemolytic activities. Genome Announcements. 5: 3-2.

Calliari A, Farías J, Puppo A, Canclini L, Mercer JA, Munroe D, Sotelo JR, Sotelo-Silveira JR. 2014. Myosin Va associates with mRNA in ribonucleoprotein particles present in myelinated peripheral axons and in the central nervous system. Dev Neurobiol. 74:382-396.

Canclini L, Wallrabe H, Di Paolo A, Kun A, Calliari A, Sotelo-Silveira JR, Sotelo JR. 2014. Association of Myosin Va and Schwann cells-derived RNA in mammal myelinated axons, analyzed by immunocytochemistry and confocal FRET microscopy. Methods. 15;66:153-161.

Shigunov P, Sotelo-Silveira J, Stimamiglio MA, Kuligovski C, Irigoín F, Badano JL, Munroe D, Correa A, Dallagiovanna B. 2014. Ribonomic analysis of human DZIP1 reveals its involvement in ribonucleoprotein complexes and stress granules. BMC Mol Biol. 3:15-12.

Sotelo JR, Canclini L, Kun A, Sotelo-Silveira JR, Calliari A, Cal K, Bresque M, Dipaolo A, Farías J, Mercer JA. 2014. Glia to axon RNA transfer. Dev Neurobiol. 74:292-302.

Número especial de la revista Developmental Neurobiology (editor).

Sotelo-Silveira JR, Holt CE. 2014. Introduction to the special issue on local protein synthesis in axons. Dev Neurobiol. 74:207-209.

actualizado el 17-04-2016.

Orientación de estudiantes:

 

Pasantías de Grado

Guillermo Eastman. (en curso). Pasantía de Grado en Genómica y Bioinformática. Orientador: José Sotelo Silveira.

Mathias Martínez. (en curso). Pasantía de Grado en Biología Celular y Molecular. Orientador: José Sotelo Silveira, Co-Orientador: Aldo Calliari.

Tesis de Grado

Tesis de Maestría

Alicia Hanusz. (en curso). PEDECIBA-Biología. Orientador: José Sotelo, Co-Orientador Jose Sotelo Silveira.

Guillermo Eastman. (en curso). PEDECIBA-Biología. Orientador: David Munroe (Frederick National Laboratory, USA) , Co-Orientador: José Sotelo Silveira.

Irene Da Cruz. 2015. PEDECIBA-Biología. Orientadora: María Vittoria Di Tomaso, Co-Orientador: Gustavo A. Folle y José Sotelo Silveira.

Joaquina Farias. (en curso). “Análisis del transcriptoma de axones mielínicos mediante secuenciación masiva”. PEDECIBA-Biología. Orientador: José Sotelo Silveira, Co-orientador: David Munroe (Frederick National Lab).

Pablo Peraza. (en curso). PEDECIBA-Biología. Orientador: Gonzalo Rincon, Co-Orientador: José Sotelo Silveira.

Valeria Romero. 2014. “Análisis de las interacciones genómicas en una región del genoma (8q24) asociada al cáncer de próstata y colon, mediante captura de la conformación de la cromatina y secuenciación masiva”. PEDECIBA-Biología. Orientador: José Sotelo Silveira. Co-Orientador: David Munroe (Frederick National Lab).

Joaquina Farias. (en curso). PEDECIBA-Biología. Orientador: José Sotelo Silveira.

Pablo Peraza. (en curso). PEDECIBA-Biología. Orientador: José Sotelo Silveira.

Tesis de Doctorado

Lucía Pastro (en curso). PEDECIBA-Biología. Orientador: Beatriz Garat, Co-Orientador: José Sotelo Silveira.

actualizado el 4-6-2014.

Docencia:

 

En contrucción

 

actualizado el 4-6-2014.

Otros:

 

En contrucción

 

actualizado el 4-6-2014.

Galería de Fotos

 

En contrucción

 

actualizado el 4-6-2014

Contacto:

José Roberto Sotelo Silveira
Mail: jsotelosilveira@iibce.edu.uy ; sotelojos@gmail.com

Teléfono: (598) 24871616 int. 112.

actualizado el 4-6-2014.